Вставляем флешку в компьютер.
Смотрим, есть ли на флешке что нибудь:

# gpart show

По умолчанию USB-флеш диск определяется в системе как da0.
Если на флешке есть данные или файловая система, то удаляем все:

# gpart destroy -F da0

Далее начинаем размечать диск на флешке так же как мы это делали при
ручной разметке диска.

# gpart create -s gpt da0
# gpart add -t freebsd-boot -s 128 da0
# gpart bootcode -b /boot/pmbr -p /boot/gptboot -i 1 da0
# gpart add -t freebsd-swap -s 512M da0
# gpart add -t freebsd-ufs da0
# newfs -U /dev/da0p3
# mount /dev/da0p3 /mnt
# exit

# vi /etc/fstab

/dev/da0p2 none swap sw 0 0
/dev/da0p3 / ufs rw 1 1